被雨水淹没过的房屋、物品等，不仅肮脏潮湿，臭味难闻，且适宜细菌繁殖，容易传染疾病，所以重新入住前，应清理室内泥污脏物，并进行彻底的消毒。具体方法是：
　　1、硫磺烟熏法：将适量的硫磺放在房屋当中，用火点着，然后关闭门窗。硫磺一经燃烧，就产生大量的二氧化硫，再同室内的水蒸气发生化合作用，从而生成亚硫酸，能起到干燥空气、灭杀病菌的良效。但是，亚硫酸有很强的腐蚀性，故应严格控制用量，切勿太大。特别要注意防火，硫磺点着后，窗外要派专人监视。
　　2、中草药烟熏消毒法：民间常采用的是中草药苍芷散。一般20平方米大小的房屋，可用苍术40克、白芷20克、木香10克，把它们放在一起研成粉，即可配成。使用时，先找一块木板放在地中，上面先放50克重的艾绒或经过揉碎的干艾叶，然后从中间点着，等起火后，慢慢地往火上撒苍芷散，关闭门窗。
　　3、枫树籽、桉树叶烟熏消毒法：这是民间传统采用的极简便消毒法，即用自采或买来的枫树籽放于青蒿上点火烟熏，或用桉树叶点火烟熏，都能达到较好的消除室内毒害的目的。
　　4、福尔马林或乳酸蒸气消毒法：在消毒前，最好先疏通炕灶，或架起火炉，把室内烘烤一下，然后再用锅蒸气熏，同样可以消毒。
　　采用上述方法消毒后，还要经常开门启窗，保持空气流通;一切能搬动的东西，要经常拿出来反复晾晒。
　　房屋进水后室内外环境的清扫消毒方法：
　　1、将门窗全部打开通风，使墙壁、地面尽快干燥。
　　2、对墙壁、地面可先用5%漂白粉上清液、0.2%优氯净、0.5%过氧乙酸、3--5%来苏尔消毒，均以每平方米300ml的剂量喷洒。
　　3、将室内衣物、被褥、草垫等日用品放在阳光下曝晒，家具表面用1：200的“84”液消毒或用以上喷洒地面的消毒液擦拭。
　　4、对室内空气消毒，可用市售空气消毒剂喷雾或用过氧乙酸熏蒸(每立方米1—3g)，用药后将门窗紧闭30分钟再开启通风。
　　5、对碗筷等餐具可进行煮沸消毒或用1：200的“84”液消毒浸泡10—20分钟，取出后用清洁水冲净再使用。
　　6、住宅周围应排除积水，清除垃圾污物及污水，清除蚊蝇等滋生地，动物尸体应集中焚烧、深埋，同时可用0.2%的敌敌畏喷洒室内外，以快速消灭蚊蝇，也可投放灭鼠药，迅速遏制鼠害。
　　凡被水淹没过的地方，内环境如地面、墙壁、桌椅板凳、门把手等，可喷洒0.5%过氧乙酸、0.2～0.5%的84消毒液或1%~3%漂白粉清液
　　处置要点：衣物、枕芯、毛毯、被褥、床垫等日用品可用2%～5%的新洁尔灭消毒液浸泡15～20分钟后，再进行常规洗涤等，也可在阳光下暴晒6小时以上。毛巾、浴巾、单件衣物可采用加热法消毒，一般煮沸5～15分钟或家庭压力蒸气锅正常工作5分钟可杀灭大多数肝炎病毒等肠道病菌(毒)及皮肤致病菌。最好少用含氯消毒剂消毒，即使消毒也要按说明书要求，切勿过量，否则衣被易被腐蚀、烂掉。
　　被污水浸泡过的米等食物，病死、淹死的家禽家畜、水产品，被水淹过的已腐烂的蔬菜、水果，来源不明的、非专用食品容器包装的和无明确食品标志的食品，严重发霉(发霉率在30%以上)的大米、小麦、玉米、花生等，其他已腐败变质的食物和不能辨认是否有毒的蘑菇等千万不要吃。这些食物即使再加工，烧熟煮透，也难以保证食后安全。